澳門回歸後，經濟持續快速發展，特區政府財政收入水漲船高，與此同時，不斷加大對教育的投入，由2007年起全面落實15年免費教育，實現人才興澳戰略。2019年澳門特區政府一般綜合預算開支約為1,033億元，其中教育方面的開支就超過130億元，根據2019年各教育機構的預算開支，其中非高等教育約佔65%，高等教育約佔35%。回歸後澳門用於教育方面的開支，比回歸當初有了很大的提升，例如，2002年非高等教育的開支只約為10億元，2019年升至約為85億元，增加了逾7倍。在逐步加大教育資源投入、注重提升教育素質的過程中，澳門猶為重視廣大學生的愛國愛澳教育。

回歸後，澳門特區政府在大力發展經濟的同時，著力積極推動教育事業發展，參照各福利國的先例，對涵蓋各教育領域的項目進行大力資助，大至15年的免費教育，小至學生的日常學習和生活津貼，加強了政府對教育事業的承擔。
2006年，澳門特區政府頒佈了《非高等教育制度綱要法》。該法規定，免費教育由原來10年正規教育拓展為15年，即包括幼兒教育、小學教育、初中教育和高中教育。 為配合貫徹執行《非高等教育制度綱要法》，2007年，澳門特區政府行政會討論通過了《教育發展基金制度》、修改《免費教育津貼制度》兩項行政法規。前一項法規規定，設立教育發展基金旨在以無償資助及優惠信貸方式，協助、推動非高等教育領域內開展的各類具發展性的教育計劃；後一項修改後的法規則進一步明確規定，居住在澳門的特區居民，加入免費教育系統私校註冊及接受正規教育的學生，均為免費教育津貼受益人。由2007年起，澳門全面推行15年免費教育。
澳門特區政府透過頒佈《非高等教育制度綱要法》進行教育改革，其指導思路一是將教育服務的內涵擴大，打破過去教育只局限於學校系統的傳統，採取學校、家庭與社會配合的“大教育觀”，同時著眼於推進終身學習的“持續教育”；二是調整學制，將原來的“小學教育預備班”改為“幼稚教育第三年”，為幼稚教育作出符合教育原理的定位，並將爭議多年的高中學制確立為3年，構建澳門教育在本土化前提下努力與國際化趨勢相一致的教育系統。
澳門推行的15年免費教育，其發展特點一是由“義務”過渡至“強制”；二是力求遵循教育均等的公平原則，例如均等學習及成功機會；三是實行有傾斜的補償措施，特別是對經濟有困難家庭和身心有問題的學生予以特別輔助；四是對公立學校和加入免費學校系統的私立學校實行全免政策，對於尚未加入免費教育系統的學校予以學費津貼補助。
雖然澳門教育仍是以私立學校為主，私立學校佔到學校總數的約八成。但作為教育公平最核心的價值，基礎教育的推展和落實得到了特區政府的大力支持，投入了大量的資金對師資和學生予以支援，特別是對私立學校就讀學生的學費資助，對落實“公共教育”以保障居民受教育的基本權利起到了重要作用。

澳門高等教育概況

特區政府在加大對非高等教育投入的同時，也積極推動高等教育改革發展，先後多次修改回歸前制訂的相關法令、法律，2017年8月7日公佈了《高等教育制度》法律；2019年2月11日透過重整職能和架構，將1992年成立的高等教育輔助辦公室升格為高等教育局，專責處理本澳高等教育事務。
澳門高等教育局網站的“澳門高等教育概況”指，澳門的現代高等教育發展只有30多年，早期由於高等院校較少，提供的課程及學術範疇亦較為單一。但隨著院校逐漸增加，以及社會對不同專業知識的需求，課程類別已日趨多元化。
澳門現有10所高等院校（澳門大學、澳門理工學院、澳門旅遊學院、澳門保安部隊高等學校、澳門城市大學、聖若瑟大學、澳門鏡湖護理學院、澳門科技大學、澳門管理學院、中西創新學院），其中4所為公立，6所為私立。2016/2017學年，各院校教學人員共2,265人，高等教育課程註冊學生32,750人，並有267個高等教育課程運作，當中包括博士學位、碩士學位、學士學位、高等專科學位、學位後文憑及高等教育文憑課程。另外，2016年共有19所外地高等院校經批准在澳門開辦了34個高等教育課程。
2019年，特區政府在4所公立高等院校的開支就達40多億元，其中澳門大學27.3億、理工學院9.13億、旅遊學院4.5億。

澳大橫琴新校區開啟“一國兩制”新篇章

澳門大學的前身為1981年創立的東亞大學，1991年易名為澳門大學。2009年6月，中央批准澳門大學在廣東珠海橫琴島上建設新校區，並授權澳門特別行政區政府在新校區內實施澳門法律和行政體系。新校區2009年12月20日奠基；2013年11月5日正式起用，比原位於氹仔徐日昇寅公馬路的校園大20倍。新校區的建成，揭開了“一國兩制”的新篇章。

2014年，國家主席習近平考察澳門大學橫琴校區時對學生們說，我是中華文化的熱烈擁護者、忠實學習者，學生時代就非常喜歡閱讀中華文化典籍，開卷有益，傳遞的是正能量。同時，要學會揚棄，取其精華、去其糟粕，賦予傳統文化時代精神。
澳大新校區面積1.0926平方公里，有80多幢建築物，可容納約一萬名學生。澳門氹仔與新校園之間以一條河底隧道連接，依法進入澳門的所有人可全天候隨時進出校園。新校園落成之後，全面推行住宿式書院制度。書院與學院相輔相成，以體驗式課程規劃提供全人教育的環境，以塑造學生的品格素養和非專業科目以外的軟實力，加強師生之間的交流和互動，凝聚學生對書院和大學的歸屬感。在新校區每個本科生都擁有一個書院的身份和一個學院的身份，學院負責學科方面的事務，而書院則負責其他的活動。在書院裡，來自不同學科、不同年級的學生一起學習、競賽、娛樂、生活。學生可從這些群體生活中增加與人互動交流、團隊合作、服務領導的機會，並且在同儕的激勵與合作之下，學習自律管理、自主行動、自我成長。
澳門大學已先後獲國家批准設立三所國家重點實驗室，分別是類比與混合信號超大型積體電路國家重點實驗室、中藥品質研究國家重點實驗室、智慧城市物聯網國家重點實驗室。

澳門城市大學發展進入快車道

2010年，陳明金先生接任亞洲（澳門）國際公開大學行政委員會主席，2011年，亞洲（澳門）國際公開大學更名為澳門城市大學。回歸後，澳門城市大學作為綜合性大學，其發展步伐進入快車道。

澳門城市大學是葡萄牙語大學聯會、葡萄牙大學校長會、國際藝術、設計與媒體院校聯盟、世界旅遊組織、粵港澳高校聯盟、世界翻譯教育聯盟、世界交通運輸脫碳聯盟等高校教育組織成員，也是澳門同時具有學士、碩士、博士授予權的4所高校之一。
澳門城市大學前身為1981年由黃景強、胡百熙和吳毓璘三位博士創辦的東亞大學，它是澳門開埠400多年來第一所中國人創辦的正式大學。1982年，先後從耶魯、港大、中大邀請饒宗頤、池田大作、羅忼烈、米勒、郭理默等教授擔任教席，饒宗頤在研究院創辦了中國文史學部並擔任主任。1985年，國家教育委員會贈送該校的九龍壁，成為澳門地標之一。

1988年，由澳門政府主導的澳門基金會收購了東亞大學並改組成為公立大學，於1991年改名為澳門大學；原東亞大學的研究院和公開學院則合併為東亞公開學院；而東亞大學理工學院則獨立為公立的澳門理工學院。1992年9月，澳門政府通過《亞洲（澳門）國際公開大學章程》，東亞公開學院更名為亞洲（澳門）國際公開大學。
2004年起，國家教育部批准亞洲（澳門）國際公開大學在中國大陸招收碩士生；從2005年起，大學可在中國大陸招收博士生；2012年，澳門城市大學獲國家教育部批准全面在內地招生本科生，學歷獲內地認可。學生畢業後，可在教育部留學認證中心辦理學歷學位認證。至此，澳門城市大學成為有資格在內地全面招生的港澳高校之一。
2015年6月，經澳門特別行政區政府批准，澳門城市大學全面進駐氹仔新校區。在進駐新校區後，連同其它兩個校區，學校的設施更加完善，這讓澳門城市大學邁向“兩岸四地一流大學”和“世界級的知名大學”的目標又近了一步。